Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngr4Q9Z1L2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr4Q9Z1L2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms