Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sumo3Q9Z172 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sumo3Q9Z172 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms