Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sh3bp5Q9Z131 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp5Q9Z131 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh3bp5Q9Z131 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp5Q9Z131 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms