Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dctn3Q9Z0Y1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dctn3Q9Z0Y1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dctn3Q9Z0Y1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms