Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E0

Ncdn, Neurochondrin, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcdnQ9Z0E0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NcdnQ9Z0E0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcdnQ9Z0E0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcdnQ9Z0E0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcdnQ9Z0E0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcdnQ9Z0E0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms