Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap4s1Q9WVL1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap4s1Q9WVL1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms