Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn5Q9WVD4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clcn5Q9WVD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn5Q9WVD4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms