Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fam50aQ9WV03 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fam50aQ9WV03 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fam50aQ9WV03 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fam50aQ9WV03 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fam50aQ9WV03 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fam50aQ9WV03 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fam50aQ9WV03 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fam50aQ9WV03 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fam50aQ9WV03 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Fam50aQ9WV03 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Fam50aQ9WV03 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fam50aQ9WV03 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fam50aQ9WV03 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fam50aQ9WV03 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms