Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uchl5Q9WUP7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uchl5Q9WUP7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uchl5Q9WUP7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uchl5Q9WUP7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms