Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1bQ9WU38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Scnn1bQ9WU38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scnn1bQ9WU38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms