Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn4Q9WU22 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn4Q9WU22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn4Q9WU22 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn4Q9WU22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms