Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax2Q9WTP9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms