Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc2Q9R244 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpc2Q9R244 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc2Q9R244 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc2Q9R244 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms