Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TfebQ9R210 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TfebQ9R210 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfebQ9R210 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TfebQ9R210 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TfebQ9R210 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms