Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trex2Q9R1A9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trex2Q9R1A9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trex2Q9R1A9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms