Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt71Q9R0H5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt71Q9R0H5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt71Q9R0H5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms