Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fhl3Q9R059 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fhl3Q9R059 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fhl3Q9R059 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms