Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr4a3Q9QZB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr4a3Q9QZB6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr4a3Q9QZB6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a3Q9QZB6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms