Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Tnnt3Q9QZ47 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnnt3Q9QZ47 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tnnt3Q9QZ47 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnnt3Q9QZ47 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms