Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Six6Q9QZ28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Six6Q9QZ28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Six6Q9QZ28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Six6Q9QZ28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms