Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SpastQ9QYY8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SpastQ9QYY8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SpastQ9QYY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SpastQ9QYY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms