Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha15Q9QYC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlha15Q9QYC3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha15Q9QYC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms