Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd1Q9QY80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd1Q9QY80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hacd1Q9QY80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hacd1Q9QY80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hacd1Q9QY80 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms