Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd4Q9QY39 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd4Q9QY39 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd4Q9QY39 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd4Q9QY39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms