Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snai3Q9QY31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snai3Q9QY31 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai3Q9QY31 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms