Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fscn3Q9QXW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fscn3Q9QXW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fscn3Q9QXW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms