Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip4Q9QXN3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip4Q9QXN3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip4Q9QXN3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms