Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim44Q9QXA7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim44Q9QXA7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim44Q9QXA7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim44Q9QXA7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms