Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chaf1aQ9QWF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chaf1aQ9QWF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chaf1aQ9QWF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms