Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cln8Q9QUK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln8Q9QUK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.1 ms