Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cnot9Q9JKY0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20,81■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20,77■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cnot9Q9JKY0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cnot9Q9JKY0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20,68■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20,68■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cnot9Q9JKY0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,9 ms