Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chrac1Q9JKP8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrac1Q9JKP8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrac1Q9JKP8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms