Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp39a1Q9JKJ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms