Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem3Q9JKE1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem3Q9JKE1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trem3Q9JKE1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 451.4 ms