Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pard6bQ9JK83 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard6bQ9JK83 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pard6bQ9JK83 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard6bQ9JK83 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms