Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc86Q9JJ89 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc86Q9JJ89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc86Q9JJ89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc86Q9JJ89 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms