Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad9Q9JIW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad9Q9JIW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad9Q9JIW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad9Q9JIW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad9Q9JIW5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad9Q9JIW5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad9Q9JIW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad9Q9JIW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad9Q9JIW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad9Q9JIW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad9Q9JIW5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1190.5 ms