Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna1fQ9JIS7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna1fQ9JIS7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1fQ9JIS7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms