Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a3Q9JHW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms