Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrip2Q9JHR9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrip2Q9JHR9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip2Q9JHR9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip2Q9JHR9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip2Q9JHR9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip2Q9JHR9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip2Q9JHR9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip2Q9JHR9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip2Q9JHR9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip2Q9JHR9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip2Q9JHR9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms