Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cxcl11Q9JHH5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cxcl11Q9JHH5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxcl11Q9JHH5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl11Q9JHH5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cxcl11Q9JHH5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cxcl11Q9JHH5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms