Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf13bQ9ET35 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13bQ9ET35 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms