Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dkc1Q9ESX5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dkc1Q9ESX5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dkc1Q9ESX5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dkc1Q9ESX5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms