Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ropn1Q9ESG2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ropn1Q9ESG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ropn1Q9ESG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms