Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp29Q9ES63 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp29Q9ES63 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp29Q9ES63 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp29Q9ES63 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp29Q9ES63 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp29Q9ES63 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp29Q9ES63 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp29Q9ES63 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms