Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrnb2Q9ERK7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrnb2Q9ERK7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrnb2Q9ERK7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrnb2Q9ERK7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.3 ms