Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb3Q9ERD7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb3Q9ERD7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb3Q9ERD7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubb3Q9ERD7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb3Q9ERD7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb3Q9ERD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb3Q9ERD7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms