Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn12Q9ER56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn12Q9ER56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms