Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr9Q9EQU3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr9Q9EQU3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr9Q9EQU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlr9Q9EQU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr9Q9EQU3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms