Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpcn1Q9EQJ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpcn1Q9EQJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpcn1Q9EQJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpcn1Q9EQJ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpcn1Q9EQJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms